Adesso viene la parte più semplice in effetti.
Tu hai creato un DSN di sistema che permette a tutti i programmi di accedere al sorgente dati(PHP compreso).
Adesso usa le funzioni ODBC ed esegui una query per creare
le varie tabelle e poi controlla se sono state create o con un altra query oppure aprendo il file .mdb
La connessione la apri così:

$DbConn = odbc_connect("nomedns", "", "");

if (!(is_resource($Db_Conn)))
die("Errore come sono sfigato stamattina\n");

http://www.php.net/manual/it/ref.odbc.php
Fammi sapere