Le cartelle con _ le puoi cancellare tranquillamente.
Usa il js, non il php.
Metti questo codice nel tag head:

Codice PHP:
<script type="text/javascript" src="/FCKeditor/fckeditor.js"></script>
    
<script type="text/javascript">
window.onload = function(){
    var oFCKeditor = new FCKeditor( 'MyTextarea' ) ;
    oFCKeditor.ReplaceTextarea() ;
    }
</script> 
Poi nella textarea usa questa sintassi:

Codice PHP:
<textarea id="MyTextarea" name="testo"></textarea
In questo esempio ho salvato i file di FCKeditor nella cartella FCKeditor.