Non mi sembra di rilevare errori, ma vorrei capire in che modo usi quel file BAT.

Settando le variabili d'ambiente in questo modo, infatti, è importante non cambiare shell dei comandi: ovvero, dovresti aprire un prompt, avviare da lì il bat e, sempre da lì, senza chiudere la finestra, avviare la compilazione.

In alternativa, prova ad utilizzare le virgolette per tutti i percorsi che contengono spazi, in questo modo:
codice:
set CATALINA_HOME="C:\Programmi\Apache Software Foundation\Tomcat 5.5";
Ciao.