Vista così, direi che si tratta di un caso di esposizione del database vecchio di Google, cosa che ogni tanto succede.
Se sei sicuro che tutti i link sono a posto, devi solo aspettare. Se vuoi forzare la mano, sulla home del sito, nella parte html, inserisci una mappa che punti alle principali sezioni. Magari temporaneamente, se non puoi renderla definitiva.