Per spostarti velocemente da una cartella ad un'altra puoi utilizzare il mouse per visualizzare le finestre corrispondenti (coasì non usi la tastiera) e poi, nella barra dell'indirizzo della finestra) scrivi il seguente comando:
codice:
%SystemRoot%\system32\cmd.exe
e vedrai magicamente apparire una finestra di prompt dei comandi già posizionata nella cartella che desideri!


Per quanto riguarda Java, esiste il metodo exec() della classe Runtime per eseguire dei file (non funziona con i comandi interni, o meglio la cosa è un po' più arzigogolata). Ad esempio, questo programma manda in esecuzione il file passato come parametro all'applicazione:
codice:
public class EseguiEsempio {
   public static void main(String [] args) {
      try {
         Runtime r = Runtime.getRuntime();
         r.exec( args[0] );
      } catch (Exception e) { e.printStackTrace(); }
   }
}
Ciao.