allora, ftp sotto windows:

http://www.microsoft.com/resources/d...en-us/ftp.mspx

nel tuo caso, potresti creare il bat

ftp -s:mieicomandi.txt mioftp

e in mieicomandi.txt metti login e operazioni che devi eseguire. Poi prova a fare lo stesso con l'altro host a cui devi connetterti.