>come si fa a fare un FMV da un WMV

flv, importandolo in flash ed esportandolo con il flash video exporter, o comprimendolo con il Sorenson Squeeze.

>Devo applicare un ulteriore compressione al video
>(comprimerlo due volte)?

No, a quel punto è sufficiente la conversione

>Qual'è secondo voi il metodo miglore per implementare
>del video streaming in un sito flash?

Per il download progressivo, caricare dinamicamente un flv "locale, per lo streaming in Flash Communication Server.