Avevo lo stessoo problema, in particolare con un grosso network di spam emgine.
Mi bruciava anche i click con tradedoubler, perchè non veniva riconosciuto il sito.

Ho messo questo codice in tutte le pagine:

<SCRIPT type="text/javascript">
<!--
if(top != self)
{
top.location = location
}
//-->

chiude automaticamente i frame, lo spam engine se la piglia dove merita, td mi conta tutti i click e il rendimento di adsense sembra migliorato