Intanto prova a dirci se stiamo parlando di Windows XP Professional o HE.
Se stai parlando di Windows XP HE ti dico subito che molti hanno dovuto disinstallare il SP2 per poter far funzionare IIS.

Per le modifiche di cui tu parli riguardo al ripescare iis del 2000 penso si tratti del sistema per far funzionare IIS su XP HE, infatti servono delle DLL da prendere dal Windows 2000.

Se si tratta di Windows XP Professional, posso dirti che io ho riformattato il computer pochi giorni fa e reinstallato XP Professional con SP2, poi ho installato IIS e tutto funziona alla perfezione e non ho sentito di problemi che non siano minimi.
Hai provato a togliere il blocco degli script dall'antivirus? O a disattivare per un momento il Firewall?