dunque, io uso un programma che si chiama COREftp che è free e fa molto bene il suo lavoro. In pratica la schermata principale è composta da 4 parti: un log dei processi, una directory del tuo disco fisso, la directory del server e la coda dei processi. Ho provato a utilizzare come su Windows i comandi TAGLIA e INCOLLA dall'interno di una directory all'interno di un'altra e il file selezionato è stato spostato correttamente.
Magari non fa proprio al caso tuo ma funziona