Non c'è bisogno che riformatti tutto, fai il defrag , magari con diskkipper se lo hai , poi ridimensioni la partiz win2000 quanto basta per liberare spazio sufficenza x l'impiego che vuoi fare di Linux , 10Gb di spazio libero non partizionato sul quale creare poi le partizioni x linux ti dovrebbero essere + che sufficenti.