no non è una vaccata:
se tu le salvi per il web stai dicendo al programma: ottimizzami i colori per internet.
Cioè gli dici che la tua Jpeg deve avere un profilo WebSafe. E quanti sono i colori della palette WebSafe? 256.
Ecco perché si scuriscono.

Se li salvi normalmente con Salva con nome non riduci il numero di colori nella palette che hai usato e la qualità della tua Jpeg sarà data dai colori del profilo che hai adoperato per lavorarla o crearla. Poi magari su internet la visualizzerai anche in maniera diversa (un pò più scura) perché il tuo browser non te la mostrerà a milioni di colori, ma le informazioni compresse nel tuo file immagine saranno complete.