Altra cosa che rallenta molto flash sono le sfumature di colore (soprattutto se l'area da riempire è ampia), i cicli onEnterFrame, e appunto come è stato detto gli intercalaggi forma o _alpha.

Potresti lanciarlo fullscreen senza scalare però il filmato all'interno con
Codice PHP:
Stage.scaleMode = "noScale"; 
ma non so se è quello che ti serve