Mi sono perso in un bicchiere d' acqua.
1-impsta il bios in modo da partire prima da usb, poi da hd.
2-quando installi linux, installa LILO sull' MBR dell' HD esterno.

In questo modo se avvi il computer con l' hd esterno collegato, ti apparirà il boot loader e potrai scelgiere se lanciare win o linux.
Se non hai l' hd esterno collegato, il boot procederà con il sistema operativo presente nel primo harddisk.

Che distro vuoi usare ?
ciao!