Tramite un linguaggio WEB la vedo dura&difficile, sono "linguaggi" troppo limitati.

Con VB, VC ecc non sarebbe difficile ma con asp, php ecc....

Con VB usi MSComm per gestire la seriale e colloquiare con il lettore (dovresti avere il protocollo di comunicazione), oppure sfrutti l'eventuale driver di emulazione tastiera tramite una semplicissima Textbox.
Poi usi ADO e l'ODBC per interfacciarti con il DB Informix per accedere alle tabelle e scaricare i dati.

Ma se non sai di cosa sto' parlando la vedo parecchio in salita....