Ok. Ti ringrazio. Effettivamente mancava l'apice. Se posso ti sfrutto ancora.
Come penso avrai capito, voglio mostrare l'avanzamento dell'upload e quindi aprire sempre nella stessa finestra una pagina che indichi il nome del file che si sta caricando (sono immagini).
Il seguente codice è il mio.
Codice PHP:
for ($i=0; $i<=($nfoto-1); $i++) {
if ($_FILES["upfile".$i][name] != ""){
$nomi[$j] = $_FILES["upfile".$i][name]; // nome che si vuole visualizzare FVisualName di Foto
echo "<script>window.open('msgUploadFile.php?nomefile=$nomi[$j]', 'upload', 'height=219,width=395,left=400,top=300,toolbar=no,scrollbars=no');</script>";
.
.
.
}
}
Inizialmente la pagina che indica l'upload ha un testo standard. Voglio che ad ogni file questa finestra standard mi venga "coperta da altre...
Il problema è che mi visualizza solo la finestra standard fino a fine upload e poi vi è una breve apparizione dell'ultima windows.open...
Sai perchè? 
In sostanza dovrebbe avvenire così:
un pop-up con:
sto scaricando -> sto scaricando file1 -> sto scaricando file2 -> ... ->sto scaricando file n
invece avviene:
sto scaricando --------> sto scaricando file n