api win32, direi che non hai scelta in questo caso, ti faccio un esempio:

codice:
#include <windows.h>

int main() {
SetCursorPos(0, 0);//sposta il mouse  al punto 00 dello schermo
return 0;
}
questo è l'unico che ricordo, poi ce ne sono anche per disegnare il cursore, caricarne uno da file, fare click e gestire le notifiche del mouse, cerca su MSDN.