così sembra a te che la apra al centro! prova a cambiare risoluzione è vedi!

prova così
codice:
<html>
<head>
<title>Popup centrata a dimensioni variabili</title>
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<script type="text/JavaScript">
<!--
function apriFinestra(nomeFinestra,url,larghezza,altezza){
sinistra=(screen.width-larghezza)/2;
alto=(screen.height-altezza)/2;
window.open(url,nomeFinestra,"left="+sinistra+",top="+alto+",width="+larghezza+",height="+altezza+",scrollbars,resizable,status");
}
//-->
</script>
</head>

<body>
link
</body>
</html>
ps. ovviamente dove ti stacca le parole tu devi scriverle tutto attaccato