Sbagli tu.
Tu devi sviluppare in base a quello che vedi in FF, e intanto adattarlo anche per IE. Il tuo problema non dipende dal bordo, quello rimane uguale per tutti i browser; l'errore sta sicuramente nelle dimensioni del div parent che puo creare problemi di questo genere oppure qualche altro parametro di posizionamento del box. Controlla bene quello e il bordo si metterà a posto da solo.