semplice, per disabilitare windows messenger fai cosi:

Pannello di controllo, Strumenti di amministrazione, Servizi

cerchi a destra messenger e ci clicchi due volte. Nella finestra che ti si apre sotto la voce TIPO DI AVVIO metti DISABILITATO dal menu a scelta.

dovresti aver risolto in questa maniera. Se ancora all'avvio è presente, vai su esegui -> msconfig -> avvio (ultima voce in alto a destra) e togli il segno di spunta a windows messenger. E già che ci sei togli il segno di spunta a quei programmi che all'avvio del sistema ti sono inutili.

Spero di esserti stato d'aiuto.