Gia' ti ho detto che winmysqladmin.exe non c'e' in mysql 4.1.11.

Se c'e' il semaforo verde segnifica che hai un daemon mysql runnig.

lancia mysql system try monitor .. questo e' il sostituto di winmysqladmin. Vai nei servizi di windows, e controlla di non avere gia' un servizio attivato. Se c'e' stoppalo e disattivalo. poi richiami il wizard e rifai la configurazione. Con questa versione (4.1.x) il direttorio di default di mysql e' cambiato. Conviene accettare quello proposto nell'installazione, perche' poi nei successivi aggiornamenti ti sara' agevolata la vita.

Cerca tutti i my.ini in giro ed eliminali o rinominali in qualcosa d'altro (meno quello di dove si trova mysql) poi vanno cancellati tutti i residui di installazioni precedenti... il file my.ini letto sara' quello dove si trova l'installazione.