In linea di massima molte direttive del php.ini sono identiche, però non puoi fare una copia pari pari, in quanto saranno poi necessari alcuni aggiustamenti, soprattutto per quel che riguarda i percorsi dei file e delle directory (ad esempio, include_path o sassion.save_path tanto per citarne un paio).

Se le versioni di php installate sono identiche, ti conviene mantenere i file originali ed apportare modifiche eventualmente solo dove serve