Per esempio potresti creare una map-link sull'immagine della mappa, nel punto in cui deve aprirsi. Dai alla map-link un anchor name e nel docice che carica il file dentro l'iframe fai caricare il file contenente la mappa puntato alla map-link di tuo interesse.

Per esempio crei una mappa nel punto che ti interessa appaia di default. Crei un anchor link #inzio e nell'iframe carichi

www.tuosito.it/files/paginamappa.php#inizio

invece che solo
www.tuosito.it/files/paginamappa.php

In questo modo nell'iframe apparirà la pagina con la mappa con la map-posizionata in alto a sinistra nel riquadro iframe.

E' semplice ocme cosa, ma forse ci ho messo troppe parole?