come dice floyd lo devi semplicemente eseguire su MySQL.
Se poi hai qualche difficoltà puoi anche installare MySQLControlCenter che ti accentua il passaggio da Access a MySQL (o comunque qualsiasi altro DBMS) visto che Access è un DBMS(se così lo si vuol chiamare) totalmente diverso dagli altri. Il programma che ti ho consigliato che non è altro che un interfaccia che ti permette di gestire i tuoi database, nonchè eseguire i file .sql.