Stai sbagliando approccio.

Per inserire delle cose si usa .innerHTML , ma nel tuo caso e` sbagliato.

La formattazione delle pagine si fa con i CSS.
Da come ti esprimi sembra che non conosci tali tecniche, per cui devi fare uno sforzo di reimplementazione.

Intanto ti sposto nella sezione CSS e XHTML; tu pero` leggiti il tutorial sui CSS di HTML.it e dai uno sguardo ad alcune pagine contenute tra i "link utili".