Salvare qualcosa nell'eseguibile significa scriverlo mentre questo è in esecuzione, operazione generalmente non concessa dal sistema operativo e, in varie forme, bloccata da (quasi) tutti gli antivirus che lo identificano come software malevolo.

In conclusione, si tratta di una soluzione - a mio avviso - da evitare.

Meglio immagazzinare i dati da un'altra parte, ad esempio un file esterno o il Registro di Configurazione.

Ciao!