si intende che i programmi del sistema operativo sono compilati per architettura x86-64
comunque perchè l'effetto sia visisbile occorre che i programmi siano scritti in maniera da poter utilizzare bene i vantaggi dei 64 bit, e nella maggior parte dei casi non è ancora così da quanto ci ho capito
e sto parlando di progammi per Linux, che ormai da anni è disponibile per 64 bit, quindi immagino che i programmi di windows siano messi ancora peggio