Soluzione un pò macchinosa, ma prova così:

Apri la pop-up richiamando solamente la pagina con i frame. Nella pagina del frame centrale, in alto dopo </head> e prima di <body> metti questo:
codice:
<script language="JavaScript" type="text/javascript">
function invia() {
document.location.href = '#puntoesatto';
}
</script>
Poi nel tag <body> metti questo attributo:
codice:
onload="invia();"
e infine metti l'ancora nella parte della pagina che preferisci:
codice:
<a name="puntoesatto"></a>