Che tipo di file è?
Controlla bene che non è aperto o usato in nessuna applicazione (se è un .exe controlla anche su task manager)...
...Per cancellare definitivamente un file dall Hard Disk, in modo definitivo (senza possibilità poi di ripristinarlo), puoi usare Eraser...
...Fai attenzione all uso che ne fai, quello che cancelli con eraser è perduto definitivamente...
ciao!