file.txt:
ciao come va


Codice PHP:
$file="file.txt";
$handle=fopen($file,"rw");
$contenuto=fread($handle,filesize($file));
$part=explode("come",$contenuto);
$contenuto=$part[0].$part[1];
fseek($file,0);
fwrite($file,$coptenuto);
ftruncate($file,strlen($contenuto));
fclose($handle); 
naturlalmente dunziona solo se la parte da togliere è univoca e si presenta una sola volta nel testo, altrimenti devi trovareun altro metodo..

ciao!