l'indicizzazione si fa esattamente come con tutti gli altri siti..

http://www.motoricerca.info/guida.phtml
http://flash-mx.html.it/faq/view_faq.asp?idcat=9&id=68

come dice nel secondo link, in linea di massima il filmato ha lo svantaggio di essere visto come immagine, quindi il motore non legge i testi interni, i link&co..