Che mi risulti si possono fare pagine con FP e poi passarle al CMS.

Credo che FP sia in grado di gestire il caricamento / scaricamento delle pagine con ftp (o simil-ftp), avendo le opportune estensioni.

Per riassumere: secondo me puoi fare una cosa fatta bene, anche se il gestore dei contenuti usa FP.
Tutto sta a scegliere il CMS opportunamente.