Ciao, prova così:

amici[0] = ["Gigio", "Maschio"];
amici[1] = ["Gigia", "Femmina"];


In alternativa:

amici[0] = new Array();
amici[0] = ["Gigio", "Maschio"];
amici[1] = new Array();
amici[1] = ["Gigia", "Femmina"];