Ciao,

secondo me ti stai incasinando la vita, non ha senso (oltre a non essere possibile) fare un'inclusione e poi eliminare l'inclusione.

Non devi includere contemporaneamente file con nomi di funzioni uguali.

Usa un'unica funzione e passale come argomenti i dati su cui lavorare.
Opure fai nella pagina principale uno switch del tipo

switch($parametro)
{
case 'qualcosa':
//fai qualcosa

case 'altro':
//fai altro

case: 'etc'
//etc.
}

E usa delle inclusioni diverse in base alle condizioni