potresti fare una proprietà (Property se usi vb) di tipo Array per i due controlli
esempio in codice sms:

codice:
'primo controllo
'ho il mio array di checkbox come proprietà dei due controlli..
'nel controllo 1 ha già un valore
CustomControl1.Array_Di_Checkbox.Add("aaa")
CustomControl1.Array_Di_Checkbox.Add("bb")
CustomControl2.Array_Di_Checkbox = CustomControl1.Array_Di_Checbox