in php puoi leggere l'orario del server con la funzione "getdate"
http://it2.php.net/manual/it/function.getdate.php
però essendo lato server è legata al ricaricamento della pagina sul browser. per fare in modo che i secondi scorrano sulla pagina visualizzata dall'utente, anche se questo non fa il reload, devi necessariamente farlo in javscript, usando purtroppo l'orario del computer dell'utente.