Questo lo devi valutare tu, in base alle tue esigenze (che io non conosco, posso solo intuirle).

Pero` se dici che ti interessa inserire il codice HTML per tre codici VB, basta che prima sostituisci quei tre, e poi elimini tutto il resto.

Con le RegExp:
(non conosco la sintassi VBS, per cui scrivo una cosa schematica)
/\[b\](\.+?)\[/b\]/i --> <span class="bb">$1</span>
/\[i\](\.+?)\[/i\]/i --> <span class="ii">$1</span>
/\[u\](\.+?)\[/u\]/i --> <span class="uu">$1</span>

/\[\.*\]/g --> ""