anche io avevo lo stesso problema e l'ho risotlo cosi:

echo"<form name=\"form1\" method=\"post\" action=\"http://www.tuosito.net/file.php\"
target=\"popup\" onsubmit=\"window.open('http://www.tuosito.net/file.php','popup','width=480,height=240,scrollbars =yes,resizable=yes')\"
>";

a me funge benone