E' chiaro, perché il livello zero è ancora attivo (sotto).
Ma non puoi eliminarlo (a meno che tu non abbia costruito i tuoi filmati in maniera particolare), devi sapere che è così e regolarti di conseguenza, per esempio, subito dopo aver lanciato il loadMovieNum, indirizzare la timeline principale in un frame dove non ci sono gli oggetti che ti disturbano...
p. es.
...
loadMovieNum("movie01.swf", 1);
gotoAndStop("label")
...

dove "label" è l'etichetta di un frame della timeline del filmato principale senza gli oggetti indesiderati.