Sei ancora troppo laconico... ma provo ad intuire

Esempio:
codice:
<script>
var precedente;
function apri(pagina) {
  if(precedente&&!precedente.closed) {
    precedente.close();
    precedente=null;
  }
  precedente=window.open(pagina,"tuaPop","width=400,height=300");
}
</script>

pippo 
pluto
ciao