Prova con CuteFTP. E' a pagamento, ma c'e' una versione trial per 30 giorni mi pare. Di sicuro con questo puoi.
Se ancora non ce la fai contatta il tuo provider, probabilmente ha messo delle restrizioni e non puoi cambiare il chmod di file o cartelle come utente, dovrebbe farlo lui come root del server...
Ciao!

RB