ho una tabella che si dimensuiona automaticamente in funzione del contenuto (recuperato tramite script lato server).

vorrei un'altra tabella che abbia la stessa altezza della prima.

io vorrei fare questo:
<table name=tabella1>....
...
...
</table>

e poi per disegnare la seconda tabella:
<script language = javascript>
document.write("<table height ="+tabella1.height+".....</table>")
</script>