Vuoi dire che 63 mega sono occupati da mysql, apache e php?
Inizia a fare un uso massiccio delle varie funzioni per liberare la memoria mysql_free_result, unset, passaggio di variabili per riferimento, poco utilizzo di funzioni tipo file(), etc.
Ci sono poi alcuni parametri di configurazione per impostare apache in maniera light che vanno dall'impostazione del timeout, al numero di thread figli, al numero di connessioni a cui rispondere. Stessa cosa puoi fare con mysql.
Consiglio lettura del manuale online di apache2 e di mysql (per quest'ultimo si dovrebbe trovare un bel po' di materiale)-