Scusami non capisco perchè fai questo casino.
Mettiamo in chiaro le cose....

Tu d'amministrazione fai l'upload del file nella cartella
/prova/prova_ftp/
e automaticamente nel database inserisci i dati che ti servono nel tabella apposita.
dopo questo l'ftp non ti serve più dato che i file li tieni in una cartella del webserver.

Lo script per il download sarà così:

$result = mysql_query("SELECT filename FROM files WHERE id_files =\"{$GET['id']}\"")or die(mysql_error());
while($row=mysql_fetch_assoc($result)){
echo"<a href=\"/prova/prova_ftp/{$row['filename']}\">scarica ol programma {$row['filename']}</a>";
}