No non penalizza, anzi dovrebbe essere la norma, anche se c'e' la brutta abitudine di fare redirect da dominio a www.dominio e non viceversa. Perche' forzare il www, dovrebbe essere il contrario di logica. Comunque se non si fa redirect significa che per il wm e per i motori sono pagine differenti quelle con www e quelle senza, anche se poi, quasi sempre, sono la stessa pagina...

Una cosa da dire che rigurda il comando link di G e' che si da spesso per scontato che link:dominio.xyz significhi richiedere a G di farci vedere alcuni link al dominio.xyz.

In realta il comando e' link:url pertanto con link:dominio.xyz otteniamo di vedere in serp alcuni link alla home del dominio.xyz e non del sito.

Per sapere quanti sono i link al sito di dovrebbero fare in teoria tante query a G quante sono le pagine del sito.

Una pagina interna potrebbe avere 20 link mostrati da G mentre la home solo 4. Quasi tutti per abitudine controllano solo link:home ma non e' esaustivo.