Perche? non ti parte lo scandisk normalmente?
vai su START > RISORSE DEL COMPUTER > DISCO LOCALE (QUI CI CLICCI SOPRA CON IL TASTO DESTRO E SELEZIONI OPZIONE "PROPRIETA")
Dalla scheda generale "proprieta" vai su strumenti( sta nella barra in alto)e da qui premi ESEGUI SCANDISK.

Per quel che riguarda la formattazione, se fai solo il ripristino, non sarai costretto a reinstallare tutti i programi, perche non verranno assolutamente cancellati, ma verra rispristinato solo windows.
Ma questo fallo solo in caso che scandisk non riesce a risolverti il problema.