Se parli di Compact Framework 1.1 e Visual Studio 2003 la risposta è ni: nel senso che è possibile farlo perchè c'è un supporto del CF agli user controls, ma non c'è un supporto di Visual Studio 2003 per crearli.
Con Visual Studio 2005 invece tutto bello e facile quanto per le applicazioni Winforms o ASP.NET.
Se ne hai la possibilità ti consiglio quindi di passare a VS 2005.

Questo argomento è stato trattato in modo dettagliato da Fabio Santini di MS Italia, puoi trovare sul suo sito le slides e le demo da scaricare: http://www.fsantini.net/Lists/Events...orm.aspx?ID=16