La soluzione è semplicissima, hai commesso un errore di sintassi.

Non devi scrivere:
cd "C:\Programmi\MySQL\MySQL Server 4.1\bin\"
Ma:
cd "\Programmi\MySQL\MySQL Server 4.1\bin\"

Senza cioè mettere "C:", perchè stai già lavorando su quell'unità.

Spero che tutto funzioni ora.