C:\Documents and Settings\Cliente\Impostazioni locali\Temp\HijackThis.exe

Significa che la cartella in cui hai salvato HijackThis non è quella guista, ma nel secondo log hai salvato il programma nella directory giusta e cioè:

C:\Programmi\Hijackthis\HijackThis.exe

Per quanto riguarda:

C:\Programmi\Internet Explorer\iexplore.exe
C:\Programmi\Mozilla Firefox\firefox.exe
C:\Programmi\MSN Messenger\msnmsgr.exe

Significa che stai navigando o hai qualche finestra di explorer o firefox aperta e sei pure connesso al messenger.

La prima regola da seguire quando si usa HijackThis è quella di tenere tutti i programmi chiusi soprattutto quelli che richiedono connessione ad internet e quindi internet explorer, Messenger, firefox ecc ecc, in caso contrario i valori fixati con HijackThis si ripresenteranno al riavvio del pc.