I file che devi eliminare si trovano nella cartella windows,purtroppo non so quali siano però,potresti cancellare anche tutta la cartella
windows, ATTENZIONE, prima fai un backup delle cartelle Desktop,preferiti,cronologia,cookies. Facendo come ti ho detto riesci a reinstallare win98 però sicuramente non funzioneranno più alcuni programmi che andranno a loro volta reinstallati